Άσκηση Εξέλιξης 3

 

                           Προσομοιοτής Δημιουργίας Κλώνων DNA

                                (Easy Cloner : Α cloning Simulator fort the ΙΒΜ PC)

 

 

 

 

 

 

Πρόγραμμα από:

Ε Shillitoe, Houston USA.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Δημοσιευμένες αναφορές:

 

Ε. Shillitoe Biotechniques June 1991.

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

                                               Copyright (C) Ε. Shillitoe 1991

                                               Αll rights reserved

 

 

 

 

 

ΕΙΣΑΓΩΓΗ.

 

Η παραγωγή ενζύμων με δυνατότητες καταστροφής των κυτταρικών τοιχωμάτων φυτοπαθογόνων βακτηρίων είναι μια σημαντική διεργασία του όλου αμυντικού μηχανισμού φυτών. Η ταχύτητα ενεργοποίησης αυτού του φυσικού αμυντικού μηχανισμού μπορεί να τροποποιηθεί ώστε να παραχθούν φυτά ανθεκτικά στα βακτήρια.

 

Με τον προσομοιωτή μεταβολής κλώνων θα μεταφέρουμε τον παραγωγό (promoter) της χυτινάσης του κουνουπιδιού στην Θέση του παραγωγού της χυτινάσης του καπνού.

 

Αυτή είναι μια περίπτωση κάθετης εξέλιξης όπου η βελτίωση του φυτού γίνεται με τροποποίηση του γενετικού υλικού.

 

ΧΡΗΣΗ ΤΟΥ ΠΡΟΓΡΑΜΜΑΤΟΣ

 

Το πρόγραμμα τρέχει με την εντολή EC CF35S οπότε εμφανίζεται ο κλώνος και ένας πίνακας επιλογής. Αυτός ενεργοποιείται είτε με ποντίκι είτε με τα πλήκτρα Fl-F12.

 

ΠΕΡΙΓΡΑΦΗ ΤΗΣ ΑΣΚΗΣΗΣ

 

Μερος lον. Επιλογή παραγωγού από CF35S και τοποθέτηση στο pΚΝΚ695.

 

Για να βρούμε το σημείο που θα κόψουμε την ακολουθία βάσεων (Pst site) στην ακολουθία CTGCAG χρησιμοποιούμε το πλήκτρο F3 (γυαλιά), γράφουμε CTGCAG και πατούμε το Enter. Η Θέση εκλογής μεταφέρεται στην βάση 1988. Για να κόψουμε την ακολουθία εκεί χρησιμοποιούμε την επιλογή F5 (ψαλίδι).

 

Κάνουμε το ίδιο και για το άλλο άκρο (θέση 3204) και το σώζουμε με την επιλογή F7 στο αρχείο TESTTUBE.SEQ. Οταν ερωτηθήτε να χρησιμοποιηθούν sticky ends απαντήστε Υ. Οταν ερωτηθήτε abandon changes in file απαντήστε Υ.

 

Τώρα με την επιλογή F2 εξετάστε τον κλώνο pΚΝΚ695 και βρείτε το Pst site όπως και προηγουμένως. Πρέπει να είναι στην Θέση 3609. Χρησιμοποιώντας την επιλογή F8 προσθέστε τώρα το τμήμα του CF35S στο σημείο αυτό.

 

Μέρος 2ον. Περιγραφή ενεργειών και σημασία πειράματος.

 

Περιγράψτε το πείραμα που κάνατε και την σημασία των κάθετων εξελικτικών διαδικασιών για την βελτίωση φυτών.

 

 

ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΑ

 

Broglie Κ. et αl. Science (1991) 254, 1194-1197

 

 


 


 

                  Δίνεται  σχηματικά  ο  κλώνος  p KNK 695 .